我發(fā)布腦膠質瘤組學數據 將向全球免費開放
科技日報北京7月8日電 (實習記者于紫月)8日,記者從首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院了解到,中國腦膠質瘤基因組圖譜計劃(CGGA)數據庫近日發(fā)布2000例中國腦膠質瘤樣本的功能基因組學數據。經過15年的臨床標本和組學數據積累,目前該數據庫日臻完善,全部基因組數據向全世界研究者免費開放。據不完全統(tǒng)計,已有美國、歐洲多家知名研究機構近200篇SCI論文引用該數據庫。
CGGA發(fā)起人和創(chuàng)建者、北京天壇醫(yī)院神經外科副主任江濤介紹,此次公布的數據涉及不同組織病理分類、不同WHO惡性度分級、原發(fā)/復發(fā)配對樣本,還包含了詳盡的臨床數據,包括患者性別、年齡、放療和化療情況、完整隨訪數據等。針對不同組學數據特點,研究團隊還開發(fā)了不同的在線分析工具,包括腦膠質瘤突變圖譜繪制、基因表達及其DNA甲基化的分布模式展示、相關性分析以及生存分析結果可視化等。
腦膠質瘤是成人最常見的顱內原發(fā)惡性腫瘤。2004年起,江濤團隊開始致力于中國腦膠質瘤生物樣本庫的建立及臨床隨訪數據的收集。在神經外科專家王忠誠院士的指導下,CGGA于2012年啟動。依托于國家神經系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心、北京市神經外科研究所以及北京天壇醫(yī)院,目前CGGA數據庫已經成為亞洲乃至全世界最大規(guī)模的腦膠質瘤醫(yī)學信息工程。
“我們希望通過基因組學技術分析,全面繪制中國人群的腦膠質瘤基因組圖譜,讓國內外更多從事腦膠質瘤的研究者可以對數據庫進行挖掘利用。”江濤表示,CGGA數據庫有助于推動腦膠質瘤新型診療模式的發(fā)展,讓更多腦膠質瘤患者獲益。